Ο Νίκος Μουλακάκης γεννήθηκε το 1951 στις Μοίρες Ηρακλείου Κρήτης. Κατάγεται από το Ρέθυμνο. Σπούδασε κλασική φιλολογία στο Πανεπιστήμιο των Ιωαννίνων· εκεί εξέδιδε το λογοτεχνικό περιοδικό "Λέξεις". Έχει οργανική θέση στο 1ο Πειραματικό Λύκειο της Πλάκας. Από το 1999 είναι αποσπασμένος στο Κέντρο Εκπαιδευτικής Έρευνας (ΚΕΕ). Συμμετείχε ως εισηγητής σε πολλά συνέδρια και επιμορφωτικά σεμινάρια. Υπήρξε ιδρυτικό μέλος και εκπρόσωπος της "Κινήσεως Φιλολόγων για τα Αρχαία Ελληνικά" (1982), η οποία αγωνίστηκε για την επαναφορά της διδασκαλίας του μαθήματος στο Γυμνάσιο. Είναι παντρεμένος και έχει μια κόρη.